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          承啟生物發布超高精度蛋白質測序方案,蛋白質測序實用化時代到來

          深圳2022年3月21日 /美通社/ -- 近日,承啟生物發布由其首席科學家、暨南大學張弓教授團隊研發的一種方便操作、超高精度蛋白質全長測序方案,準確率可達99-100%,刷新了迄今為止的世界紀錄。該方案使得蛋白質測序實用化,在生物學、醫學、生物安全、法醫物證等領域有廣闊的應用前景。

          蛋白質是由20種氨基酸組成的長鏈,是所有生命功能的實際執行者。氨基酸序列決定著蛋白質的功能,絕大多數疾病都是由于蛋白質的異常而導致的。雖然絕大部分蛋白質由基因轉錄翻譯而來,但許多機制可以使蛋白質序列在這個過程中發生變化,一個基因可以產生少則一兩種、多則幾萬種不同的蛋白質,因此對蛋白質的序列進行直接研究就尤為重要。

          蛋白質測序的精準化和實用化,在許多領域可以產生前所未有的應用。例如,利用蛋白質測序比核酸測序更快速、更不容易被污染干擾的特點,癌癥、老年癡呆等重疾的早篩和診斷將變得更加快捷方便;遇到生物安全事件(如重大疫情)時,蛋白質測序能幾個小時內快速鎖定病原體,大幅縮短疫情初期明確病原體的周期,為應對疫情爭取寶貴時間;抗體藥物研發過程中對篩選出的優秀抗體進行直接測序,將可以很快通過合成生物學方法大量生產這種抗體,大大縮短抗體藥物的研發周期;蛋白質測序技術也可以輕松破解被國外壟斷的蛋白質制劑,大幅度降低藥品價格;測定從環境中分離到的具有優異特性的蛋白質,如細菌真菌中降解各種污染物的酶,加以改造和工業應用,可實現綠色環保低碳的發展目標。

          蛋白質測序技術在1967年就已出現,這比基因測序技術早了約10年,然而現在基因測序技術已高度成熟發達,蛋白質測序技術卻一直進展緩慢,完整度低、精準度低、成本高,導致蛋白質測序一直沒有得到大范圍的應用。這其中最大的區別在于,DNA可以準確地進行復制或互補配對,幾乎所有基因測序技術都基于此,而蛋白質無法復制,也無法依據序列來配對。

          張弓教授團隊在基因測序方面深耕多年,其全自主開發的FANSe系列核酸測序算法是迄今為止穩健性和準確性最高的比對算法,同時具備很高的容錯性。團隊將基因組測序中的分步拼接和使用FANSe進行高精度校正的思想移植到蛋白質測序上,對蛋白質質譜分析進行了策略改進,對同一樣品的多份質譜數據進行自我比對和校正,最終對蛋白質全長序列的測序準確度達到了空前的99-100%,甚至可以發現買來的標準品蛋白中存在著突變。在不同結構特性的多個蛋白質的測試中,一律能達到近乎完美的全長測序結果,除非質譜儀測不出原始數據。更令人欣喜的是,這個策略甚至能應對質量較差的、有污染的實驗數據,同樣能穩健地輸出準確的結果。實驗操作簡便,算法也大部分可自動化運行,因此這種方法成本低、速度快、易于推廣。

          正如基因測序精準化、廉價化之后引發人類生活和產業的巨變一樣,蛋白質測序精準化、廉價化,將又一次給人類社會帶來巨變。

          目前,這一蛋白質測序方法的論文已在分析化學的權威期刊Analytical Chemistry上發表,算法可在承啟生物網站上免費下載:http://chi-biotech.com/mucs/

          參考資料:Highly Robust de Novo Full-Length Protein Sequencing, Anal. Chem. 2022, 94, 8, 3467–3475

          消息來源:深圳承啟生物科技有限公司
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